醫(yī)療領(lǐng)域應(yīng)用大數(shù)據(jù)技術(shù)的難題:收集信息

責(zé)任編輯:jacky

2014-06-09 08:40:17

摘自:網(wǎng)易科技報(bào)道

早期的醫(yī)學(xué)研究成果或病人的病歷,往往鎖在醫(yī)藥公司的檔案或醫(yī)生辦公室的文件柜中。墨菲稱,如果把攻克癌癥比喻為一座高山,目前已接近頂峰的邊緣,這一高度是前所未有的。

醫(yī)療領(lǐng)域應(yīng)用大數(shù)據(jù)技術(shù)的難題:收集信息

6月8日消息,科技博客網(wǎng)站recode.net今天發(fā)表文章稱,許多機(jī)構(gòu)的研究人員正在探索如何利用人工智能和大數(shù)據(jù),為癌癥等疑難病癥找到更好治療方法,目前已取得進(jìn)展,但他們?cè)谑占颊咝畔⑸嫌龅诫y題。

文章主要內(nèi)容如下:

IBM、波士頓制藥公司 Berg Pharma、紀(jì)念斯隆-凱特琳癌癥中心(Memorial Sloan Kettering)、加州大學(xué)伯克利分校(UC Berkeley)及其它機(jī)構(gòu)的研究人員,正在探索如何利用人工智能和大數(shù)據(jù),找到更好的疾病治療方法。

但是,在醫(yī)療領(lǐng)域充分利用這些計(jì)算工具面臨的最大挑戰(zhàn)是,這方面的海量數(shù)據(jù)被束之高閣——或者說從一開始就沒有數(shù)字化。

早期的醫(yī)學(xué)研究成果或病人的病歷,往往鎖在醫(yī)藥公司的檔案或醫(yī)生辦公室的文件柜中。

病人的隱私問題、公司間的利益沖突以及純粹缺乏電子病歷,阻礙著醫(yī)療領(lǐng)域的信息共享,讓每一次治療都像一個(gè)孤立的事件。如果醫(yī)療領(lǐng)域的信息共享能取得進(jìn)展,人們很有可能發(fā)現(xiàn)更具普遍意義的治療方案。

加州大學(xué)舊金山分校的講師邁克爾·凱澤(Michael Keiser)指出,當(dāng)你能夠?qū)?0萬個(gè)病人的臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)和電子病歷進(jìn)行分析時(shí),與以往只能接觸少數(shù)病人的信息相比,你將能發(fā)現(xiàn)以往所不能發(fā)現(xiàn)的治療方案。

鑒于這樣的前景,一些組織開始著手將醫(yī)療數(shù)據(jù)整合在一起。

去年年底,美國臨床腫瘤學(xué)會(huì)(American Society of Clinical Oncology,ASCO)宣布了旗下“CancerLinQ”項(xiàng)目的初步進(jìn)展情況。“CancerLinQ”是一個(gè)“快速學(xué)習(xí)系統(tǒng)”,允許研究人員進(jìn)入、訪問和分析匿名癌癥患者的病歷。

今年4月,一個(gè)有眾多主要制藥公司參與的非營利性組織——“癌癥生命科學(xué)協(xié)會(huì)CEO圓桌會(huì)(the CEO Roundtable on Cancer)”,宣布推出PDS計(jì)劃(Project Data Sphere)。該計(jì)劃將打造一個(gè)第三階段癌癥臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)共享和分析平臺(tái),初始數(shù)據(jù)集已由阿斯利康、拜耳、新基醫(yī)藥(Celgene)、紀(jì)念斯隆-凱特琳癌癥中心、輝瑞、賽諾菲等共同提供。

這些數(shù)據(jù)已去除患者的個(gè)人信息,并進(jìn)行了統(tǒng)一編號(hào),供生命科學(xué)公司、醫(yī)院、醫(yī)療機(jī)構(gòu)以及獨(dú)立研究者可以免費(fèi)使用。他們可以訪問平臺(tái)內(nèi)置的分析工具,或者將數(shù)據(jù)插入到自己的軟件中。

癌癥CEO圓桌會(huì)議首席執(zhí)行官馬丁·墨菲(Martin Murphy)表示,PDS計(jì)劃可能有助于發(fā)現(xiàn)鮮為人知的癌癥候選藥物,這些藥物可能對(duì)某些癌變有一定的療效。而在某一特定研究中,這些藥物可能會(huì)因?yàn)闆]有達(dá)到研究的主要目標(biāo)而被拋棄。

其它推進(jìn)醫(yī)療領(lǐng)域信息共享的努力還包括:由從多醫(yī)療機(jī)構(gòu)、研究型大學(xué)、生命科學(xué)公司等組建的全球基因組學(xué)與健康聯(lián)盟(Global Alliance for Genomics and Health)、歐洲生物信息研究所(EMBL-EBI)維護(hù)的分子生物數(shù)據(jù)庫,以及美國國立衛(wèi)生研究院(National Institute of Health, NIH)成立的“生物標(biāo)記共同體(Biomarker Consortium)”等。

與此同時(shí),用大數(shù)據(jù)服務(wù)腫瘤醫(yī)療行業(yè)的初創(chuàng)公司Flatiron Health上月完成了1.3億美元 B 輪融資,由谷歌旗下風(fēng)投機(jī)構(gòu)谷歌風(fēng)投(GoogleVentures)領(lǐng)投。Flatiron Health 打造了一個(gè)“腫瘤學(xué)云平臺(tái)(OncologyCloud)”,能提取和整合病人電子病歷(EMR)中的臨床數(shù)據(jù)以及醫(yī)療費(fèi)用數(shù)據(jù)。

該系統(tǒng)使在醫(yī)生辦公室和醫(yī)院以不可持續(xù)和非結(jié)構(gòu)化格式留存的數(shù)據(jù)變得有意義,從而能夠?qū)Υ笠?guī)模癌癥患者群體的治療情況進(jìn)行分析。理想情況下,它可以發(fā)現(xiàn)哪種治療方法對(duì)哪些類型的癌癥患者有效。

Flatiron Health 聯(lián)合創(chuàng)始人奈特·特納(Nat Turner)表示:“Flatiron Health專注于所謂‘真實(shí)世界’患者的臨床資料。在美國,只有4%的癌癥患者會(huì)參與前瞻性臨床試驗(yàn),因此我們正在努力提取和整合剩下96%患者的數(shù)據(jù)。”

他說:“要真正了解什么對(duì)癌癥有效,其他患者正在接受什么樣的治療,以及癌癥領(lǐng)域的研究取得了什么樣的成果,相關(guān)機(jī)構(gòu)應(yīng)該開放“去識(shí)別(de-identified)”的醫(yī)療數(shù)據(jù)和匿名的典型病例,這是Flatiron Health愿景的一部分。”

隱私風(fēng)險(xiǎn)

可以肯定的是,推進(jìn)醫(yī)療信息的開放應(yīng)該非常謹(jǐn)慎。醫(yī)療信息是高度敏感的,所以任何隱私風(fēng)險(xiǎn)需求應(yīng)慎重考慮。

醫(yī)療信息能開放到什么程度,取決于全社會(huì)所做出的讓步。許多人堅(jiān)定地持有這樣的觀點(diǎn):挽救生命最重要。但受舊習(xí)慣和過時(shí)規(guī)章制度的影響,社會(huì)的轉(zhuǎn)變速度還不夠快,這一點(diǎn)加州大學(xué)伯克利分校的計(jì)算機(jī)科學(xué)教授大衛(wèi)·帕特森(David Patterson)深有感觸。帕特森致力于用于癌癥研究的機(jī)器學(xué)習(xí)工具。

他說:“對(duì)于計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的研究人員,我們習(xí)慣于互聯(lián)網(wǎng)時(shí)間和摩爾定律。但現(xiàn)在我們無法讓官方達(dá)成一致,讓我們能夠大量快餐收集數(shù)據(jù)并進(jìn)行整合,這是非常令人沮喪的。”

他指出:“患者的隱私很重要,但爭(zhēng)取癌癥治療領(lǐng)域取得進(jìn)展同樣很重要。將大量治療信息匯集在一起的好處是,我們可以在攻克這種可怕疾病方面取得進(jìn)展。”

這些接受采訪的專家,還沒有誰能例舉出目前為止大數(shù)據(jù)等計(jì)算技術(shù)對(duì)癌癥治療帶來了什么突破。畢竟,這些技術(shù)都是新的,而且醫(yī)療數(shù)據(jù)集剛剛整合在一起,臨床試驗(yàn)又需要數(shù)年時(shí)間。

但幾乎所有人都同意,在癌癥治療方面,研究人員正處于重大突破的邊緣。

墨菲稱,如果把攻克癌癥比喻為一座高山,目前已接近頂峰的邊緣,這一高度是前所未有的。

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