神經(jīng)學家使用大數(shù)據(jù)工具分析大腦細胞活動

責任編輯:editor006

2014-07-29 14:14:33

摘自:鳳凰科技

北京時間7月29日消息,據(jù)《每日科學》網(wǎng)站報道,大數(shù)據(jù)時代,單靠一臺電腦并不總能找到用戶最需要的解決方案。相反,計算任務(wù)應(yīng)該分布于計算機集群,讓集群計算機共同分析大數(shù)據(jù)集。

北京時間7月29日消息,據(jù)《每日科學》網(wǎng)站報道,大數(shù)據(jù)時代,單靠一臺電腦并不總能找到用戶最需要的解決方案。相反,計算任務(wù)應(yīng)該分布于計算機集群,讓集群計算機共同分析大數(shù)據(jù)集。這也正是谷歌、Fa

鳳凰科技訊北京時間7月29日消息,據(jù)《每日科學》網(wǎng)站報道,大數(shù)據(jù)時代,單靠一臺電腦并不總能找到用戶最需要的解決方案。相反,計算任務(wù)應(yīng)該分布于計算機集群,讓集群計算機共同分析大數(shù)據(jù)集。這也正是谷歌、Facebook挖掘你的瀏覽歷史,并呈現(xiàn)你需要的廣告的技術(shù)。但是,大數(shù)據(jù)并沒有止步于此。用于監(jiān)控腦部活動的最新技術(shù)帶來了所未有的大量信息。理解這些數(shù)據(jù),或許能讓人類對自己大腦的工作原理產(chǎn)生新的認識。為此,神經(jīng)學家利用分布式計算工具Thunder(閃電),進行了大量研究。

  監(jiān)控腦部活動的最新技術(shù)帶來了所未有的大量信息

Thunder是一個工具庫,由霍華德·休斯醫(yī)學研究所(Howard Hughes Medical Institute)的Janelia研究園開發(fā)。Thunder可以提高數(shù)據(jù)分析速度,原本這些海量數(shù)據(jù)在一個工作站上要跑上數(shù)天或數(shù)周。相關(guān)研究成果發(fā)表在7月27日的期刊《自然·方法學Nature Method》中。加州大學伯克利分校的科學家Jeremy Freeman、Misha Ahrens等人完成了此項研究。

更為重要的是,他們還使用Thunder分析一種顯微鏡下的成像技術(shù)。Ahrens及其同事使用這種技術(shù)觀測斑馬魚對視覺刺激做出回應(yīng)時的腦部細胞活動。這一研究成果同樣發(fā)表在《自然·方法學》中。

Freeman、Ahrens表示,使得單一計算機難以超越瓶頸的因素并非只有數(shù)據(jù)的巨大規(guī)模,還有數(shù)據(jù)的復(fù)雜性。“當你記錄大腦活動的信息時,你不知道分揀自己需要數(shù)據(jù)的最佳辦法。每個數(shù)據(jù)集都各不相同。對某些數(shù)據(jù),你或許有想法,但這是否有意義,還有待探討。”

神經(jīng)學家在第一次考慮數(shù)據(jù)的時候,很少能迸發(fā)新的思路。相反,最初的研究可能暗含更有希望的方法,只需要進行少量調(diào)整、使用新的計算分析,原來的數(shù)據(jù)就可以更有用途。

這也就是為什么使用龜速的計算工具分析神經(jīng)學數(shù)據(jù)會讓人大為受挫。Freeman提到:“對一些分析來說,你可以上傳數(shù)據(jù),開始跑數(shù)據(jù),第二天再回來看。但如果你需要調(diào)整分析,重新再跑一遍,就必須再等上一個晚上。”

通過使用Thunder,F(xiàn)reeman和Ahrens可以在幾分鐘內(nèi)分析成像結(jié)果,不需要等待很長時間就可以針對分析結(jié)果進行策略調(diào)整。

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