對(duì)話諾獎(jiǎng)得主Gilbert:我所理解的大數(shù)據(jù)和全基因組測(cè)序

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2014-10-08 11:11:01

摘自:生物探索

沃特·吉爾伯特(Walter Gilbert)是一位美國(guó)物理學(xué)家與生物化學(xué)家,分子生物學(xué)的早期研究者之一。我認(rèn)為有些公司申請(qǐng)基于某個(gè)特定基因會(huì)產(chǎn)生某些疾病的基礎(chǔ)上的診斷方法(基因測(cè)試)是可以授予專利的。

Knowing your DNA will is not a panacea.-by Walter Gilbert

沃特·吉爾伯特(Walter Gilbert)是一位美國(guó)物理學(xué)家與生物化學(xué)家,分子生物學(xué)的早期研究者之一。

1980年與弗雷德里克·桑格因?yàn)榘l(fā)展了測(cè)定DNA序列的方法,而與保羅·伯格(Paul Berg)共同獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。他運(yùn)用桑格直讀法原理,獨(dú)立地提出更簡(jiǎn)便的測(cè)定核苷酸順序的方法——化學(xué)降解法。他用化學(xué)反應(yīng)將DNA裁剪成一系列不同長(zhǎng)度的核苷酸片斷,它們的一端相同,并標(biāo)有放射性同位素,測(cè)定各片斷的長(zhǎng)度和另一端最后一個(gè)核苷酸,就能決定DNA相應(yīng)位置上的排列順序。

2014年在德國(guó)巴伐利亞州林道召開(kāi)的“The Lindau Nobel Laureate Meetings”(林道的諾貝爾獎(jiǎng)得主會(huì)議)上,來(lái)自美國(guó)Rice University(萊斯大學(xué))的Mohit Kumar Jolly采訪了這位開(kāi)創(chuàng)了測(cè)定DNA序列的方法的諾貝爾獎(jiǎng)得主。

Walter Gilbert和Mohit Kumar Jolly2014年在林道

Mohit Kumar Jolly (MKJ): 看來(lái)您的介紹,您曾獲得在劍橋大學(xué)拿到數(shù)學(xué)博士后,很快成為哈佛大學(xué)的理論物理教授,后來(lái)又從事分子生物學(xué)工作,并在諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)?lì)I(lǐng)域取得成就。您能跟我們談?wù)勈侨绾巫龅皆谶@3個(gè)不同的領(lǐng)域跨界的嗎?

Walter Gilbert (WG):其實(shí),在我的人生中,已經(jīng)多次改變研究領(lǐng)域,因?yàn)槲乙恢毕胩剿餍率挛?。我在大學(xué)里,是學(xué)習(xí)化學(xué)和物理的科班出身,但卻發(fā)現(xiàn)化學(xué)無(wú)聊,于是我專注于高能量的量子場(chǎng)論。

在取得我的博士學(xué)位后,我在哈佛大學(xué)從事物理教學(xué),主要研究量子力學(xué)和電磁學(xué)。

后來(lái),我在英國(guó)劍橋的一次聚會(huì)上遇到了詹姆斯·沃森(James Watson)。他給了我六篇文章,讓我了解他們?cè)谧龅姆肿由飳W(xué)實(shí)驗(yàn)。我參觀了他們的實(shí)驗(yàn)室后,覺(jué)得他們的工作很有趣。

因此,在送走了我?guī)У募磳厴I(yè)的理論物理學(xué)畢業(yè)生后,我成為了一名分子生物學(xué)家。

在那個(gè)時(shí)間點(diǎn)上,我甚至還開(kāi)了一家名叫"Biogen"的生物公司,并且在上世紀(jì)80年代擔(dān)任了該公司5年的CEO。這對(duì)于一個(gè)搞科研的人來(lái)說(shuō),真是一個(gè)完全不同的體驗(yàn)。

在2002年,我關(guān)閉了我的實(shí)驗(yàn)室;現(xiàn)在我成為了一個(gè)當(dāng)代藝術(shù)品的生產(chǎn)商和消費(fèi)者。

Walter Gilbert :“I have always found it very easy to change fields. In this process, I have realized that the purpose of education is to make you think about all different kinds of things in the world.”

——我一直認(rèn)為跨界并不是一件很難的事,在這個(gè)過(guò)程中,我認(rèn)為教育的最終目的是“讓你思考世界上不同的人和事”!

Gilbert向另一個(gè)諾獎(jiǎng)得主Brian Kobilka展示其作品

Mohit Kumar Jolly (MKJ): 我們知道您曾因發(fā)現(xiàn)DNA測(cè)序而獲得諾貝爾獎(jiǎng),那您是從什么時(shí)候意識(shí)到全基因組測(cè)序會(huì)越來(lái)越便宜的呢?

Walter Gilbert (WG):DNA測(cè)序費(fèi)用會(huì)不斷下降,這是意料之中的事情。在1985年的時(shí)候,個(gè)人的全基因組測(cè)序費(fèi)用高達(dá)30億美元;而在今天,完成一個(gè)人的全基因組測(cè)序僅需5萬(wàn)美金。我希望:到2020年,無(wú)論是醫(yī)院還是第三方檢測(cè),個(gè)人全基因組測(cè)序的費(fèi)用可以下降到幾百美金。

但是大家需要注意的是,全基因組測(cè)序并不意味著一定是“精準(zhǔn)醫(yī)療”,我曾經(jīng)對(duì)我自己的全基因組進(jìn)行了測(cè)序,但是它忽略了局部的基因組重排,因此這算不上是絕對(duì)的“精準(zhǔn)醫(yī)療”。

或許在普通人看來(lái),只要我們進(jìn)行了全基因組測(cè)序后,就可以通過(guò)編輯我們的基因來(lái)設(shè)計(jì)高智商的后代,但是我只能說(shuō)這是個(gè)“神話”,因?yàn)樵谏飳W(xué)上,并不是一個(gè)基因就對(duì)應(yīng)唯一屬性。

Walter Gilbert talking to a Young scientist at #LNLM14

Mohit Kumar Jolly (MKJ):目前有關(guān)“個(gè)性化醫(yī)療”的主題討論得相對(duì)火熱,您怎么看待“個(gè)性化醫(yī)療”的前景?

Walter Gilbert (WG):站在我個(gè)人角度,我是很看好“個(gè)性化醫(yī)療”的發(fā)展的。然而現(xiàn)在市場(chǎng)上對(duì)“個(gè)性化醫(yī)療”存在2大對(duì)立的觀點(diǎn)。

站在患者的角度,每一個(gè)患者都有不同的新陳代謝機(jī)制,即使是患了同一種疾病也會(huì)有不同的臨床表現(xiàn)。同樣的癌癥,在不同人的身上表現(xiàn)亦不同。目前唯一的辦法就是將它們分類成有限的亞型,然而開(kāi)發(fā)針對(duì)這些亞型的藥物,但是它們的有效率并不是很高。

另一種觀點(diǎn)是站在大藥廠、藥物研發(fā)商的角度,他們并不喜歡“個(gè)性化醫(yī)療”,他們更喜歡標(biāo)準(zhǔn)化的方式;否則,他們大批量生產(chǎn)的“仿制藥”怎么賣?

讓我很困惑的是:藥企為什么沒(méi)有意識(shí)到“當(dāng)基因測(cè)序越來(lái)越深入,其病例的亞型就將分類的越來(lái)越細(xì),這將進(jìn)一步有助于藥物的臨床試驗(yàn)”。因此我認(rèn)為,制藥大亨們想要占領(lǐng)“基因測(cè)序”市場(chǎng)的制高點(diǎn),他們得首先轉(zhuǎn)變下自己的觀念。

Mohit Kumar Jolly (MKJ):當(dāng)下在生命健康領(lǐng)域的另一個(gè)熱門話題是“大數(shù)據(jù)”,您怎么看?

Walter Gilbert (WG):“大數(shù)據(jù)”即是要收集大量的數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)基因和疾病之間的相關(guān)性。毫無(wú)疑問(wèn)的是,我們收集的數(shù)據(jù)是有作用的,但是問(wèn)題是,很多時(shí)候我們不知道如何解釋它。

另外,你必須記住,所有的統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著性并不意味著生物學(xué)上的顯著。所以說(shuō),大數(shù)據(jù)絕對(duì)不是萬(wàn)能的。

Mohit Kumar Jolly (MKJ):最近還有一個(gè)爭(zhēng)議性較多的問(wèn)題,是關(guān)于“基因?qū)@?rdquo;申請(qǐng)的,您怎么看待“基因?qū)@?rdquo;申請(qǐng)的?

Walter Gilbert (WG):我同意最高法院的決定,即我們不能申請(qǐng)任何自然存在的物種的專利。由于基因是個(gè)體的一部分,因此我認(rèn)為它不應(yīng)該被允許申請(qǐng)專利。

不過(guò),我認(rèn)為有些公司申請(qǐng)基于某個(gè)特定基因會(huì)產(chǎn)生某些疾病的基礎(chǔ)上的診斷方法(基因測(cè)試)是可以授予專利的。

并且我認(rèn)為,專利完全是一種倫理道德上的行為。它屬于一種社會(huì)上層建筑,給做出了某項(xiàng)發(fā)明的作者提供回報(bào)的壟斷行為。因此,專利只能控制商業(yè)行為,而不是用來(lái)獨(dú)霸學(xué)術(shù)研究的,科學(xué)研究更應(yīng)該是開(kāi)發(fā)的與共享的。

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