容器技術(shù)幫助推動(dòng)科學(xué)研究的重現(xiàn)性

責(zé)任編輯:editor006

2017-07-05 16:11:22

摘自:solidot

容器通過(guò)將運(yùn)行所需軟件要求配置的計(jì)算環(huán)境的關(guān)鍵要素打包進(jìn)一個(gè)輕量級(jí)的虛擬機(jī),減少了這種復(fù)雜性。加州伯克利國(guó)家能源研究科學(xué)計(jì)算機(jī)中心計(jì)算機(jī)專(zhuān)家 Deborah Bard 已幫助很多研究人員在實(shí)驗(yàn)室的超級(jí)計(jì)算機(jī)上安裝了他們的軟件。

BioinformaticContainers.jpg

科學(xué)家使用的一種容器技術(shù)是 Docker 。加州大學(xué)戴維斯分校生物信息學(xué)家 C. Titus Brown 介紹說(shuō),實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的工具極少能拿來(lái)就用,它們通常以必須接受處理和配置的腳本或者源代碼的形式存在。大多數(shù)軟件需要額外的工具和程序庫(kù),但用戶(hù)可能并未安裝。即便用戶(hù)能獲得軟件并運(yùn)行它,計(jì)算環(huán)境的不同也會(huì)無(wú)意中改變其性能并且影響可重復(fù)性。容器通過(guò)將運(yùn)行所需軟件要求配置的計(jì)算環(huán)境的關(guān)鍵要素打包進(jìn)一個(gè)輕量級(jí)的虛擬機(jī),減少了這種復(fù)雜性。加州伯克利國(guó)家能源研究科學(xué)計(jì)算機(jī)中心計(jì)算機(jī)專(zhuān)家 Deborah Bard 已幫助很多研究人員在實(shí)驗(yàn)室的超級(jí)計(jì)算機(jī)上安裝了他們的軟件。她回憶說(shuō),安裝用于望遠(yuǎn)鏡模擬和分析的復(fù)雜軟件通道之前需要三四天。利用容器則將這一時(shí)間

鏈接已復(fù)制,快去分享吧

企業(yè)網(wǎng)版權(quán)所有?2010-2024 京ICP備09108050號(hào)-6京公網(wǎng)安備 11010502049343號(hào)